原第四军医大学的前身为八路军晋西北军区卫生学校，创建于1941年，1948年11月进驻西安，先后更名为西北军区人民医学院、中国人民解放军第一军医学院。1952年10月，奉中央军委命令，命名为中国人民解放军第四军医大学。学校曾隶属于中国人民解放军原总后勤部，2015年12月，转隶中央军委训练管理部；2017年6月，划归空军建制领导管理；2017年7月，空军军医大学正式组建。