我系成立于2013年1月，时名医学心理系。2017年11月新编制调整后，正式更名为军事医学心理学系，前身可追溯至1960年设立的空军医学系心理学教学组。主要承担军队医学心理学专业人才培养、军事心理学研究以及为部队官兵提供心理服务等任务。60多年来，在陈南宜、皇甫恩、苗丹民等几代学科带头人的努力下，为我国军事心理学科奠定了引领发展的地位。

是军队后勤科研重点实验室、中国心理学会军事心理学专业委员会、全军心理学专业委员会、全军心理卫生研究中心、全军心理测评技术中心、全国征兵心理检测技术中心、空军招收飞行学员心理选拔技术中心挂靠单位；国家教育部高等学校心理学教学指导委员会、中国社会心理学会军事心理学专业委员会、中国心理学会心理学普及工作委员会、全军心理卫生专家咨询和指导委员会、陕西省心理学会等学会副主任/副理事长单位。围绕军事人员心理选拔与岗位分类、作战心理与信息损伤防护、军事应激与军事环境心理三个研究方向开展科学研究。

博士生导师6人，硕士生导师13人。全国优秀科技工作者1人，陕西省教学名师1人，军队高层次创新工程领军人才1人，全军杰出专业技术人才1人，全军后勤工作先进个人1名，全军院校育才奖金奖1人、银奖3人，一等功荣立者1人，担任国家二级学会副主委以上4人，空军级专家1人，空军高层次科技人才6人，1人兼任国防大学客座教授，9人获批学校人才工程扶持项目。